1) Александр Васильевич была ли разница в пантеонах богов в различных частях Руси ?
   1. Была !  Но какова ? Об этом трудно судить из-за скудности первоисточников.
   Могу отметить лишь то, что (как мне кажется) Симаргл встречался только у росов.

   2) Почему скифо-сарматский Вий остался в народной памяти южнорусов, а не остался в памяти южно-великорусов ?
   2. Вий (из "второго ряда" божеств древнерусского пантеона), по-моему, сохранился в дворянском (а не в крестьянском) фольклоре. Дворянский фольклор хуже записан чем крестьянский.
Южно-русские (украинские) бояры (влившиеся затем в казацкую старшину) дольше сохраняли (в силу своего более "природного" быта) традиционные (вплоть до начала 19 в.) семейные предания, чем великорусские дворяне, переформатированные петровско-екатерининскими реформами.
   Однодворцы же серьёзно не исследовались.

3) У южно-великороссов скифо-сарматский компонент более значителен? Вы также  писали что на Черниговщине и Сумщине первенствует скифо-сарматская часть этногенеза, разве эти края не были фактически перезаселены полищуками после 1618 года ?
3. Оставалось и определённое меньшинство.
Полищуки (и у них был (хотя и меньший) скифо-сарматский компонент) продвинулись со стороны Любеча. Со стороны же Прилук и Конотопа расселились украинцы. У них свой существенный андроновский компонент.
   Чисто визуально -- андроновский компонент в обеих областях существенен. Хотя на Сумщине, пожалуй, посильнее, чем в Черниговщине.

     А. В.